Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rpl28P41105 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpl28P41105 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms