Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sox7P40646 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sox7P40646 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox7P40646 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox7P40646 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sox7P40646 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms