Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf2P39429 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf2P39429 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf2P39429 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf2P39429 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf2P39429 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf2P39429 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms