Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtlP38585 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtlP38585 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TtlP38585 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtlP38585 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TtlP38585 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtlP38585 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtlP38585 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtlP38585 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtlP38585 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtlP38585 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtlP38585 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtlP38585 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TtlP38585 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TtlP38585 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TtlP38585 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtlP38585 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtlP38585 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtlP38585 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtlP38585 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms