Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PpardP35396 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PpardP35396 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PpardP35396 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PpardP35396 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PpardP35396 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PpardP35396 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PpardP35396 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PpardP35396 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PpardP35396 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PpardP35396 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PpardP35396 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PpardP35396 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PpardP35396 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PpardP35396 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PpardP35396 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PpardP35396 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PpardP35396 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PpardP35396 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PpardP35396 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PpardP35396 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PpardP35396 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PpardP35396 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PpardP35396 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms