Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab23P35288 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab23P35288 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab23P35288 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab23P35288 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms