Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Apoc1P34928 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms