Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tfap2aP34056 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms