Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc10P31257 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms