Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctnnd1P30999 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctnnd1P30999 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms