Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Kif5cP28738 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kif5cP28738 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms