Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NapbP28663 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NapbP28663 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NapbP28663 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NapbP28663 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NapbP28663 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NapbP28663 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NapbP28663 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NapbP28663 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NapbP28663 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NapbP28663 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NapbP28663 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NapbP28663 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NapbP28663 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NapbP28663 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NapbP28663 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NapbP28663 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NapbP28663 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NapbP28663 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NapbP28663 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NapbP28663 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NapbP28663 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NapbP28663 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NapbP28663 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NapbP28663 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NapbP28663 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NapbP28663 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NapbP28663 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NapbP28663 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NapbP28663 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NapbP28663 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NapbP28663 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NapbP28663 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NapbP28663 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NapbP28663 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NapbP28663 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NapbP28663 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NapbP28663 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NapbP28663 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NapbP28663 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NapbP28663 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NapbP28663 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NapbP28663 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NapbP28663 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NapbP28663 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NapbP28663 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NapbP28663 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms