Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc6a9P28571 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc6a9P28571 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms