Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja4P28235 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gja4P28235 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja4P28235 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms