Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb1P28230 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gjb1P28230 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms