Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gjc1P28229 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gjc1P28229 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjc1P28229 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjc1P28229 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjc1P28229 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjc1P28229 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjc1P28229 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjc1P28229 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjc1P28229 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjc1P28229 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjc1P28229 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjc1P28229 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gjc1P28229 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms