Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lef1P27782 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lef1P27782 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lef1P27782 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lef1P27782 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lef1P27782 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lef1P27782 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lef1P27782 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lef1P27782 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lef1P27782 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lef1P27782 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lef1P27782 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lef1P27782 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lef1P27782 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lef1P27782 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lef1P27782 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lef1P27782 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lef1P27782 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lef1P27782 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lef1P27782 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lef1P27782 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lef1P27782 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lef1P27782 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lef1P27782 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lef1P27782 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lef1P27782 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lef1P27782 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lef1P27782 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms