Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SnrpbP27048 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SnrpbP27048 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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