Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria1P23818 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria1P23818 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria1P23818 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria1P23818 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gria1P23818 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms