Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfyaP23708 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfyaP23708 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms