Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tsta3P23591 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms