Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ggta1P23336 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms