Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja1P23242 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja1P23242 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms