Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PparaP23204 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PparaP23204 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PparaP23204 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PparaP23204 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PparaP23204 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PparaP23204 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PparaP23204 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PparaP23204 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PparaP23204 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PparaP23204 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PparaP23204 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PparaP23204 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PparaP23204 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PparaP23204 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PparaP23204 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PparaP23204 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PparaP23204 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PparaP23204 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PparaP23204 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PparaP23204 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PparaP23204 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PparaP23204 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PparaP23204 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PparaP23204 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PparaP23204 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PparaP23204 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PparaP23204 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PparaP23204 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PparaP23204 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PparaP23204 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PparaP23204 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PparaP23204 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PparaP23204 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms