Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Eif3aP23116 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Eif3aP23116 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms