Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkcaP20444 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcaP20444 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms