Protein–RNA interactions for Protein: P20334

Tnfrsf9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf9P20334 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfrsf9P20334 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnfrsf9P20334 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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