Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Csn1s1P19228 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csn1s1P19228 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms