Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnnc1P19123 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnnc1P19123 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms