Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rps6ka1P18653 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rps6ka1P18653 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms