Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa-rs1P17533 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa-rs1P17533 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms