Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vpreb2P13373 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb2P13373 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms