Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr4a1P12813 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr4a1P12813 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms