Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chrm1P12657 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chrm1P12657 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms