Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Tnp1P10856 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms