Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P10404 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P10404 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P10404 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P10404 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P10404 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P10404 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P10404 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P10404 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P10404 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P10404 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P10404 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P10404 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P10404 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P10404 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P10404 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P10404 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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