Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tmem254aP0DN89 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmem254aP0DN89 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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