Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Amd1P0DMN7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Amd1P0DMN7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms