Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UbbP0CG49 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UbbP0CG49 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms