Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb2P0C1T1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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