Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06323 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06323 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06323 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06323 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06323 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06323 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06323 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06323 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06323 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06323 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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