Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgamP05555 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ItgamP05555 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ItgamP05555 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms