Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Saa2P05367 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Saa2P05367 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms