Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifna1P01572 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms