Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Casp8O89110 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Casp8O89110 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms