Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccl20O89093 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ccl20O89093 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ccl20O89093 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccl20O89093 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccl20O89093 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ccl20O89093 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccl20O89093 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccl20O89093 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Ccl20O89093 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccl20O89093 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ccl20O89093 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccl20O89093 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccl20O89093 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccl20O89093 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ccl20O89093 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccl20O89093 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl20O89093 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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