Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hcn2O88703 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hcn2O88703 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms