Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops3O88543 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops3O88543 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops3O88543 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cops3O88543 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops3O88543 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms