Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CntfrO88507 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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