Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vti1bO88384 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vti1bO88384 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms